陸委會疫情後相當著重對兩岸宗教、學術等交流的「強化安全管理」，在宗教上多次強調中共是「無神論」，近期還頻繁到不同宗教團體溝通，「把相關政府法規介紹給他們」，提醒不要觸犯、違反規定。我方政府選前對宗教團體處理兩岸交流的示警意味相當濃厚。陸委會副主委詹志宏26日下午就媒體詢問官方近期在宗教與學校層面的「溝通內容」時表示，「中共是信奉無神論，既然是無神論，為什麼又會對台灣積極推動所謂的『宗教交流』，這是很矛盾的事情，很顯然有宗教以外目的」。
他透露，最近陸委會官員分別拜訪不同宗教團體，親自前往各地跟宗教領袖、幹部交流座談，最主要就是要了解目前兩岸之間宗教交流情況，「也把相關政府法規介紹給他們，讓他們知道在合法範圍內，政府是鼓勵兩岸民間交流，但也提醒他們，哪些法令有約束跟限制，希望他們不要觸犯、違反規定」。
儘管詹志宏也提到「合法範圍內政府鼓勵兩岸民間交流」，但他揭示政府與宗教團體的溝通，更重要的是介紹「中共利用宗教、各種名目操作統戰、分化、滲透的手法、案例」。
他說，台灣民間信仰大家非常虔誠、非常單純，尤其民眾是跟著信仰尊崇神祇，並不會刻意注意到神祇後面有沒有中共的政治目的，「這是我們最主要跟他們來說明、溝通的事項」。
公開資料顯示，詹志宏今年來已多次提及中共是無神論的立場，以此質疑兩岸宗教交流。
不過他從未提到1978年10月中共中央轉發中央統戰部《關於當前宗教工作中急需解決的兩個政策性問題的請示報告》後，確立宗教信仰自由的「憲法」規定必須實踐；大陸國務院2018年4月3日發布的《中國保障宗教信仰自由的政策和實踐》白皮書，也強調「實行宗教信仰自由政策」、「最大限度團結廣大信教公民和不信教公民」。
至於湄洲媽祖團傳出11月要來台巡安的案件審核有沒有進度？詹志宏則表示，有詢問過主管機關，持續審理中，最新了解是他們有提出需要補件或者補充說明之處，已經通知台灣的邀請單位，目前大概進行到這個流程。
而目前團員有沒有中共官員？他則進一步說明，我方拿到的團員的名冊「比較簡略」，主觀機關會要求每個人做「詳細身分說明」，這部分尊重主觀機關，這是屬於專案，由主管機關逐一認定。最後確認到底有沒有官員、「不相干」的人，「在審查時都會注意到」。
此前詹志宏在7月27日曾公開表示，鑒於近期以來，國人赴陸不斷遇到人身自由與安全受侵害以及被不友善對待的違常個案，為降低風險，陸委會提醒前往從事「學術交流、宗教」活動的國人，如非必要，建議暫時不要前往大陸。
先前在6月新北市先嗇宮舉行「海峽兩岸共祭中華人文始祖伏羲典禮」時，邀請函上主辦單位為甘肅省公祭伏羲大典活動領導小組辦公室、甘肅省政府台灣事務辦公室、新北市三重區先嗇宮。當時陸委會強調，先嗇宮與甘肅省台辦共同主辦典禮活動，疑涉及違反「兩岸條例」規定，將會同相關主管機關進行查處。
