腸病毒威脅大，抗疫等同國防，因此腸病毒的疫苗市場也具備高度需求，對此，中國大陸政府致力於扶植疫苗產業，積極推動對岸EV71型疫苗開發。迄今，大陸已有兩家國營藥廠，包括中國醫科院、國藥中生武漢，及一家民營公司北京科興，開發出腸病毒EV71型疫苗，並在大陸本土銷售，超車台灣。
世界衛生組織（WHO）今年發布「重點傳染疾病開發（R&D）藍圖」，評估將腸病毒71型與D68型，納入優先重點名單中，這兩型腸病毒不僅對美國造成威脅，更在亞洲各國如台、日等國家流行。
業界指出，全球目前僅有五家疫苗廠的腸病毒疫苗進入後期開發，其中，中國大陸三家、台灣兩家，後者包括高端疫苗、國光生，台灣的疫苗產業仍有技術優勢，實力堅強可望搶進全球市場。
在疫病肆虐，強勁的市場需求下，中國大陸的腸病毒疫苗，即使自費仍開出紅盤。根據統計，中國去年三家疫苗供應商出貨首發量高達1,480萬劑，以自費打每劑以人民幣268元概算，其市場逾6億美元（約新台幣177億元），後續成長空間仍大。
業界指出，多年前台灣疫苗開發進度比大陸更快，但由於大陸官方積極推動產業、防疫工作，台灣僅有民間自己摸索、努力，迄今雖然進度稍慢，也做到了臨床三期試驗，離上市僅臨門一腳。
台灣未來若有政府協助，依照生醫臨床法規為標準，以防疫為著眼、推動產業為價值，規劃國內腸病毒疫苗「市場先期（採購）承諾」計畫，預期將能讓廠商產生更大誘因，加速打造防疫價值鏈，提升台灣自體防疫能量。
不過，業界也指出，2012年時疾管局（疾管署前身）曾研擬仿效WHO的經驗，規劃在國內推動市場先期承諾採購計畫，渠料，囿於部分審查人士的防弊思維，以「可能圖利特定廠商」的說法，讓該案胎死腹中，此舉也讓中國大陸在腸病毒疫苗研究逐漸超車台廠，搶先在對岸上市。
另受制於法規限制，中國大陸疫苗尚無法進入台灣，當前，也仍難進入東南亞市場，進一步說，大陸市場的腸病毒疫苗技術仍不如台廠。
若能透過政府有關機關如衛福部、疾管署的協助，以台灣的疫苗開發能力與標準，必能儘速打入新南向諸國，創造產業利基。
提高自製能力…當務之急
防疫政策不僅影響國安，也牽動產業發展，業界指出，不僅腸病毒疫苗開發是台灣當務之急，另包括流感、登革熱等疫苗，未來台灣都應該要具備自行產製的能力。因此，業界呼籲，只要台廠根據法規標準所開發出來的疫苗，官方應站在保護、扶植自家產業的立場，編列預算採購給國人施打，以達到官民產三贏。
台灣的疫苗自行產製率極低，不如歐美各國，甚至低於日、韓、中，在亞洲國家中，屬於末段班，僅有8%，相較於美國百分百，中、日則在六到八成以上，可謂敬陪末座。
據悉，由於腸病毒盛行於亞洲地區，疫苗開發進度當前則以台灣、大陸較快，領先日韓，而台灣過去曾經有腸病毒EV71型大流行的紀錄，儘速推動國內自行開的腸病毒等疫苗上市，是當務之急。
站在產業的角度看，目前大陸的疫苗雖然已經上市，但是限於「規格」問題，仍無法跨出中國大陸，僅能留在對岸自行施用。台廠在技術優勢下，加上擁有國際認可的PIC/S GMP優良藥廠製造規範，而東南亞也陸續加入該協約組織，未來若能順利打入該市場，雙方將能儘速達成產品上市的共識。
這兩年，政府積極發動新南向政策，而東南亞國家當前並無疫苗工業，而以腸病毒為例，該地區的盛行率甚至超過台灣十倍，其需要疫苗之孔急，應為亞洲地區之冠。
